“闇之=书事件_ ”[（参照魔法少女奈叶A’s,]）[ `的10年后。踏入1%)9歳的高町奈叶# 、菲特·T·哈洛*\温!`]、八神疾风三人，$/怀@抱着彼此的友情牵绊、为#,了 #追求各自的梦想实现而加入时空管理局，并以一流魔)!导, `/师的身分活(跃。在此当中，出现了新 发现的太古@(遗产“圣遗晶[:!石”（レリック）.:，以及以此为目-_!标而出现$的谜样机械兵器“共鸣拓发 ) 者”（ガジェットドローン）。为了迅速对应日后被称为“圣遗;_晶石事件
+:”的状况，八神疾风考虑] 到`设置能够迅],:速对应的独立_:部队的必要性，设[立了专责处理与太古遗产关连任务的特殊部队——“机动六课`$#”。另!一边，时-间回溯到\四年前。昴·中岛 ].?在遭到机场火灾卷入而?几乎丧命之际，由于奈叶?!的出/+)现而得救。因为憧] 憬著如同“?,自己理\^想中的形象”一般的+.奈叶，昴在当晚的;)满天星]空之下)(，,.. 做@
出].了^].“成为
管理局的魔导师”$;的决定。 ]四年后，经过一番波折而顺利成为管理局的新进魔导师的昴，与训练校时代的伙伴蒂雅娜·兰斯特共同挑战魔导师 ^的升格*=试验。于远处凝视%:著两人考试的，分别是认定两人将成为“机动六课”的!明日之星而投以注意.*的疾风与菲特、还有奈叶。在三人的注视之中，随着宣告试验\^开始的ReinForc))eII（统御之力zwei）的!`\$声音，拉开了“Strike\-rS_”故事的序幕。