曾经@，来自海洋的神秘敌人“塞壬”向人类,发起了 猛烈的进攻，“$!碧蓝航线%”的少女*们.凭借))着她们钢铁般的意志与敌人 奋勇作战，最终击败了对]:手，守护了人类。+,..,然而，随 `着时间 的流逝，碧_蓝航线内,部因为理念的差异逐渐产生分化，衍生出了);#名为“赤色中\轴”大的对立阵营。被称为“`灰/色 的幽灵” :的最强#[英雄企^+?业（^石%,川由依配音）、@;\每+%]天都迷迷糊糊(但关 键时刻意外的顶用的拉菲（/.?.长绳`麻理!亚\?配音）、虽然年纪不大但成熟体贴的大黄蜂?（:.山本@
希望配音），个性好强但心%,地善良的哈曼（伊藤明日香配音），面!
对动荡的时局，当这些少女们再一次被推上战场，会发!生怎样的故事呢？