漆黑的夜晚 # ，一名间谍悄然潜入日本警方某机构，盗走了记载^!#着各国谍报机+(构重要/(数#=[据的绝密文件的绝密数$%据!)。日本警方和FB I探/^!员赤=井
秀一（池田秀一配音）
;+?旋即与间谍展开追逐。最后，逃亡者的车=\*辆坠落悬崖。第二天，]柯南（高@)山南配音）和伙伴们来到东都水族馆观光，结果 $,发现一名受伤^%的美丽女子$?（天海佑] #`希配音）。+该女子处于失忆状态(，$@身上的手机也破损无法使用。柯^)
南等人答=+应\[=要帮她恢复(记)(忆，当他们七嘴八舌之际(，藏在暗处的黑衣组-
织成员贝尔摩德（小山 ^!( 茉美配音）冷冷地注视着这一切。在相处过_#程中[#，女子非凡`)的,\;身手和奇)-\怪的言行举止让灰原^哀（林原惠美配音）对其真%实身份产生 `=怀疑。刚刚还一派祥和的水族馆，! ^;沉 ,`浸在快乐之中的人们，根本会想到随着那名神秘女 $,子技艺:^的恢复，自己马上@:就要被
卷入黑暗#`组织的 ^杀戮和_混!$乱之中……